我校十分重视重点研究基地的建设。1995年，我校历史学科首先被国家教委批准为"国家文科基础学科人才培养和科学研究基地"，这是北京市属高校中唯一的一个国家文科基础学科人才培养和科学研究基地。几年的建设，成效显著。2001年10月，该基地在教育部终期验收中被评为优秀基地，其研究水平居于国内同类研究的前列，基地建设水平居于全国高校前列。2001年4月，我校中国诗歌研究中心（Chinese Poetry Research center of Capital Normal University）被教育部批准为"全国省属高等学校人文社会科学重点研究基地"，研究人员的主体为我校教师，同时聘请了十几位校外知名学者做兼职研究员。基地采取了全新的运作模式，设立开放性课题，每年主办两次国内或国际学术研讨会，并创办了"国学"网站，该网站目前是国内同类专业网站中"点击率"最高的网站，为弘扬、传播中国传统文化作出了突出贡献。
2002年北京市教委批准在我校建立"生命科学人才培养与产学研基地"；2003年9月教育部首都师范大学课程研究和发展中心在我校批准成立；2004年9月北京市教育委员会和北京市哲学社会科学规划办公室联合评选确立我校北京创新研究基地为首批北京市哲学社会科学研究基地之一，使我校重点基地建设取得重要进展。
